您好，我母亲在北京交通事故脚上跖骨，指骨两处骨折，

根据《中华人民共和国民事法院诉讼程序法》第十六条，民事诉讼中不能进行伤残评级。在您母亲的跖骨骨折案件中，您可以向交通事故旁责方要求给予经济补偿。因为跖骨的治疗会遭受较长的恢复期，对您母亲的双腿机能长期处在影响和痛苦之中，您可以联系当地专业的律师请求法律援助，或者向当地的人民法庭提出申诉和请求。